Nature Biotechnology:借菌造药:噬菌体巧用大肠杆菌打造活体药物车间

时间:2025-02-21 12:12:19   热度:37.1℃   作者:网络

引言

您是否想过,一种曾让医学界束手无策的病毒,竟能化身精准的"微型制药厂"?2月18日《Nature Biotechnology》的最新突破“Sustained in situ protein production and release in the mammalian gut by an engineered bacteriophage”,研究人员成功将噬菌体,这种自然界最古老的病毒杀手,改造成为肠道内的蛋白质生产大师。研究团队通过基因工程技术,让T4噬菌体在感染大肠杆菌时,像特洛伊木马般释放治疗性蛋白质,成功在小鼠模型中逆转结肠炎进程、遏制肥胖发展。这项颠覆性技术不仅攻克了口服生物制剂(Oral Biologics)难以在消化道存活的世纪难题,更开创了利用宿主共生菌群作为"活体药物工厂"的全新治疗范式。

传统口服药物面临三重炼狱:胃酸的强腐蚀环境(pH 1.5-3.5)、肠道蛋白酶的降解风暴、以及大分子药物的吸收壁垒。这使得胰岛素、单克隆抗体等生物制剂至今仍需注射给药,导致患者依从性不足50%。而工程益生菌虽能定点生产药物,却常因肠道菌群竞争惨遭淘汰。这项研究另辟蹊径,将噬菌体改造成"智能药物载体":当它们感染肠道共生大肠杆菌时,会启动内置的gp22启动子,在裂解细菌的瞬间释放预先编码的蛋白质药物。这种"借鸡生蛋"的策略,既避开了胃部消化系统的绞杀,又巧妙利用噬菌体与宿主菌的动态平衡实现持续给药。

在结肠炎小鼠模型中,携带丝氨酸蛋白酶抑制剂(Serpin B1a)的工程噬菌体,使炎症标志物中性粒细胞弹性蛋白酶(Neutrophil Elastase)活性骤降68%,同时促进抗炎型CD24+中性粒细胞增殖。更令人惊叹的是,在饮食诱导的肥胖模型中,表达细菌热休克蛋白ClpB的噬菌体,通过模拟饱腹信号肽α-MSH,使小鼠日均摄食量减少22%,血清炎症因子IL-23水平降低53%。这些突破不仅验证了技术的治疗潜力,更揭示了微生物组工程从"菌群调控"到"分子编程"的范式跃迁。当病毒与人类从对抗走向共生,这场静默的医疗革命正在重新定义未来药物的可能性。

图片

当病毒成为盟友:颠覆认知的医疗新思路

在我们与致病菌的百年战争中,噬菌体(Bacteriophage)——这种专门感染细菌的病毒,一直被视为潜在的"生物导弹"。但《Nature Biotechnology》最新发表的研究,为这个古老的抗菌武器赋予了颠覆性的新使命:研究人员成功将T4噬菌体改造成能在哺乳动物肠道内持续生产治疗性蛋白质的"微型制药厂"。

研究团队利用噬菌体感染肠道共生大肠杆菌(Escherichia coli)的特性,通过基因工程使其在细菌裂解时释放特定的治疗蛋白。在结肠炎(Colitis)和饮食诱导肥胖(Diet-Induced Obesity, DIO)的小鼠模型中,这种"智能噬菌体"分别实现了炎症因子抑制和体重控制的双重突破。这项技术突破不仅为口服生物制剂(Biologics)的递送难题提供了创新解决方案,更开启了利用肠道微生物作为活体药物工厂的新纪元。

肠道给药困境:为什么99%的生物制剂无法口服

传统口服药物需要突破三重屏障:

胃酸绞肉机:胃部pH值低至1.5-3.5,90%的蛋白质类药物在此失活

酶解风暴:胰腺分泌的蛋白酶(Protease)可在30分钟内降解胰岛素(Insulin)等大分子

吸收瓶颈:分子量超过500 Da的药物难以穿透肠上皮细胞

这使得目前获批的100多种生物制剂中,仅有利那洛肽(Linaclotide)等极少数能实现口服给药。研究数据显示,慢性病患者对需每日注射的药物治疗依从性不足50%,严重制约了治疗效果。

噬菌体的进化:从"细菌杀手"到"蛋白质工厂"

T4噬菌体的改造过程堪称分子生物学的精妙设计:

基因定位:在噬菌体基因组非必需区域插入外源基因(sfgfp/serpinb1a/clpB)

智能调控:采用噬菌体特异性启动子(gp22 promoter),确保基因表达与感染周期同步

裂解释放:利用噬菌体裂解周期(Lytic Cycle)的自然特性,将治疗蛋白释放至肠道黏膜

实验数据显示,改造后的T4::sfgfp噬菌体在小鼠肠道黏膜产生的超折叠绿色荧光蛋白(Superfolder GFP)浓度达到1.5×10⁴ AU/OD,是背景荧光的300倍。这种时空可控的蛋白质生产方式,成功规避了传统工程菌面临的定植竞争难题。

炎症性肠病的精准打击:让噬菌体"驯服"失控的免疫

在溃疡性结肠炎(Ulcerative Colitis)模型中,研究团队展示了令人振奋的结果:

中性粒细胞弹性蛋白酶(Neutrophil Elastase, NE)活性:T4::serpin组较野生型降低68%(P<0.0001)

结肠炎病理评分:黏膜厚度增加40%,CD24+抗炎中性粒细胞比例提升2.3倍

体重变化:在7天葡聚糖硫酸钠(Dextran Sulfate Sodium, DSS)诱导期,治疗组多维持5.2%的体重

这种通过噬菌体递送丝氨酸蛋白酶抑制剂(Serpin B1a)的策略,不仅中和了过度活跃的NE,更重要的是通过CD24-Siglec信号轴重塑了免疫微环境。这种"治本"而非"治标"的干预方式,为慢性炎症疾病提供了全新治疗范式。

对抗肥胖的"分子骗局":肠道里的饱腹感骗局

在饮食诱导肥胖模型中,噬菌体展现了更复杂的调控能力:

ClpB蛋白的拟态魔法:其五氨基酸基序与α-MSH(α-Melanocyte-Stimulating Hormone)同源,激活肠道内分泌细胞MC4R受体

代谢改善:治疗组日均摄食量减少22%(2.8g→2.2g),夜间活动量增加37%

炎症缓解:血清IL-23、IL-1α水平分别下降53%和41%,肝脏脂肪变性面积缩小28%

有趣的是,尽管噬菌体裂解导致大肠杆菌数量周期性波动,但工程噬菌体在肠道中的存续时间超过25天。这种持续的药物生产能力,突破了传统益生菌需要每日补充的技术瓶颈。

安全与平衡:改写微生物组的"外科手术刀"

为确保技术安全性,研究团队进行了全方位评估:

血清生化指标:治疗组谷丙转氨酶(ALT)反较对照组降低18%,提示潜在肝保护作用

菌群分析:16S测序显示主要菌群(拟杆菌门/厚壁菌门)比例保持稳定(Bray-Curtis相似性>0.82)

耐药性监测:1920个大肠杆菌分离株中未发现噬菌体抗性突变

这种精准靶向特定菌株的特性,避免了广谱抗生素对肠道菌群的"地毯式轰炸"。研究还发现,噬菌体更易富集在肠道黏液层(Mucosal Lining),这种空间特异性进一步降低了脱靶风险。

从实验室到餐桌:未来医疗的三大想象

这项技术突破可能催生以下应用场景:

慢性病管理:糖尿病患者的肠道持续分泌GLP-1类似物,取代每周注射

个性化营养:根据肠道菌群特征定制噬菌体鸡尾酒,实现精准代谢调控

太空医学:在微重力环境下维持宇航员肠道稳态,预防菌群失调

研究团队正在探索将技术拓展至人源化crAssphage(一种拟杆菌噬菌体),未来或可实现"一次给药,终身受益"的治疗模式。

我们不是在消灭微生物,而是在教导它们成为我们的制药伙伴。

微生物组的文艺复兴

该研究标志着人类对肠道微生物组的认知从"敌人清单"转向"合作伙伴名录"。当噬菌体从单纯的抗菌武器进化为可编程的生物反应器(Bioreactor),我们正站在一个新时代的门槛上——在这里,疾病治疗不再是外来化合物与身体的对抗,而是生命系统与生命系统的对话。或许不久的将来,每个人的肠道中都运行着一座精密的"微生物制药厂",而这场静默的医疗革命,此刻正在我们体内悄然启幕。

参考文献

Baker, Z.R., Zhang, Y., Zhang, H. et al. Sustained in situ protein production and release in the mammalian gut by an engineered bacteriophage. Nat Biotechnol (2025). https://doi.org/10.1038/s41587-025-02570-7

上一篇: Nat Commun:樊少华/关玉婷/金...

下一篇: Nature Methods:活细胞中的...


 本站广告