导读

软组织肉瘤是指来源于非上皮性骨外组织的一组恶性肿瘤，是一组高度异质性肿瘤，占所有恶性肿瘤的1%。软组织肉瘤可以发生于任何年龄人群，几乎可以发生于身体任何部位，最常见的亚型包括未分化多形性肉瘤、脂肪肉瘤、平滑肌肉瘤、滑膜肉瘤、胃肠道间质瘤等。对于局限期患者，手术为主要治疗手段，对于肿瘤巨大无法手术切除、远处转移的患者，化疗为主要治疗手段，但其预后并未见显著改善，中位生存期不足2年，存在未被满足的医疗需求。

最新研究表明免疫检查点抑制剂（immune checkpoint inhibitor, ICI）在一部分转移性软组织肿瘤患者中获得持久的应答，但绝大多数软组织肿瘤没有应答。在一些特定的组织学类型如未分化多形性肉瘤有较高的应答率，但其他组织学类型如平滑肌肉瘤对ICI应答率较低。然而，传统的预测ICI应答的生物标志物如肿瘤突变负荷（tumor mutational burden, TMB）、PD-L1表达似乎不能预测软组织肉瘤疗效。

肿瘤微环境由复杂的细胞群落组成，对肿瘤发生发展、对治疗的反应至关重要。既往研究仅对有限的细胞类型进行分析，发现肉瘤微环境中特定的细胞类型与预后和治疗反应相关。本研究采用了机器学习框架EcoTyper，利用带有临床注释的批量转录组大规模鉴定了构成肉瘤的基本细胞状态和细胞生态系统。一共验证了23种肉瘤特异性的、经转录组定义的细胞状态，其中许多状态在独立数据集中对患者预后具有高度预测作用。进一步发现了三种保守的细胞群落或生态型，它们与潜在的基因组突变和不同的临床结果相关。并且，由肿瘤相关巨噬细胞和上皮样恶性细胞定义的一种生态型可以预测对免疫检查点抑制剂的反应，但不能预测对化疗的反应。本研究结果有助于识别能从免疫疗法中获益的软组织肉瘤患者，并有助于开发新的治疗策略（Nat Cancer. 2024 Apr;5(4):642-658. doi: 10.1038/ s43018-024-00743-y）。